新型冠狀 病毒的檢測方法主要包含核酸檢測、抗體檢測、抗原檢測幾種方法。由于抗原檢測檢出率較低，目前新冠檢測主要集中在抗體和核酸檢測。核酸檢測目前是新型冠狀 病毒檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)”，具有早期診斷、靈敏度和特異性高等特點；但抗體檢測操作便捷、檢測迅速，可作為核酸診斷的補充手段，但由于抗體檢測“假陽性”和“假陰性”的局限性，不適合用于復(fù)工復(fù)產(chǎn)復(fù)學(xué)等普通人群篩查，也不適用于在低流行地區(qū)的流行病學(xué)調(diào)查。

檢測原理：

所有生物除朊病毒外都含有核酸，核酸包括脫氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）。新型冠狀 病毒(2019-nCoV)屬于Beta冠狀 病毒屬(Betacoronavirus)，該病毒是蛋白包裹的單鏈正鏈RNA病毒，寄生和感染高等動物（包括人）。病毒中特異性RNA序列是區(qū)分該病毒與其它病原體的標(biāo)志物，新型冠狀 病毒出現(xiàn)后，我國科學(xué)家已經(jīng)成功發(fā)現(xiàn)了新型冠狀 病毒中的特異性核酸序列。如疑似患者樣本中能檢測到新型冠狀 病毒的特異性核酸序列，則認為該患者可能被新型冠狀 病毒感染。 新型冠狀 病毒常用的核酸診斷方法有兩種：病毒核酸特異基因檢測和病毒基因組測序。較常見的檢測新型冠狀 病毒特異性核酸序列的方法是熒光定量PCR（聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）。由于新型冠狀 病毒是RNA病毒，試劑盒檢測基本都采用反轉(zhuǎn)錄加實時聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)法（RT-PCR），擴增病原體的核酸 (RNA) ，同時通過熒光探針實時檢測擴增產(chǎn)物。在PCR反應(yīng)體系中，包含一對特異性引物以及一個Taqman探針，該探針為一段特異性寡核苷酸序列，兩端分別標(biāo)記了報告熒光基團和淬滅熒光基團。探針完整時，報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收；如反應(yīng)體系存在靶序列，PCR反應(yīng)時探針與模板結(jié)合，DNA聚合酶沿模板利用酶的外切酶活性將探針酶切降解，報告基團與淬滅基團分離，發(fā)出熒光。每擴增一條DNA鏈，就有一個熒光分子產(chǎn)生。熒光定量PCR儀能夠監(jiān)測出熒光到達預(yù)先設(shè)定閾值的循環(huán)數(shù)（Ct值）與病毒核酸濃度有關(guān)，病毒核酸濃度越高，Ct值越小。不同生產(chǎn)企業(yè)的產(chǎn)品會依據(jù)自身產(chǎn)品的性能確定本產(chǎn)品的陽性判斷值。

由于每個RT-PCR反應(yīng)需要2個小時左右才出結(jié)果，因此，試劑盒在開發(fā)時一般都針對病毒序列中高度保守的2-3個序列比如編碼replicase（復(fù)制酶）或者necleocapsid（核蛋白衣，核鞘）的核酸序列設(shè)計引物，但是各個方法用的序列都不完全相同。一些方法使用multiplex，也就是把多個目標(biāo)序列在同一反應(yīng)管中擴增；另一些采用分步，先用一個目標(biāo)序列篩查，陽性后再用另一個序列確認，這樣可以有效縮短整個流程時間，加快檢測速度。另外RNA病毒變異很快，用多個保守目標(biāo)序列可以防止病毒變異造成的假陰性。

目前批準(zhǔn)產(chǎn)品均基于新型冠狀 病毒基因組中開放讀碼框1a/b（open reading frame 1ab，ORF1ab）、包膜蛋白（Envelope protein，E）和核衣殼蛋白（nucleocapsid protein，N）進行選擇。不同產(chǎn)品的檢測原理基本一致，但是其引物、探針設(shè)計存在不同，有單靶區(qū)段（ORF1ab）、雙靶區(qū)段（ORF1ab、N蛋白）、三靶區(qū)段（ORF1ab、N蛋白和E蛋白）的檢測和判讀差別。一般檢測位于病毒ORF1ab和N基因上的兩個靶標(biāo)，同一份標(biāo)本需滿足雙靶標(biāo)陽性或重復(fù)檢測為單靶標(biāo)陽性或兩種標(biāo)本同時滿足單靶標(biāo)才能確認SARS-CoV-2病毒核酸陽性。

檢測流程：

檢測程序需要經(jīng)過五個步驟，取樣、留樣、保存、核酸提取、上機檢測。首先根據(jù)試劑盒說明書進行樣本采集，樣本類型包括咽拭子、鼻拭子、痰液、支氣管灌洗液、肺泡灌洗液等。由于RNA易降解，因此，采集樣本時使用無RNA酶的拭子和無RNA酶的儲存管。獲得患者樣本后，需盡快進行檢測，如無法立即檢測需要進行低溫封裝，并送到專門的檢測機構(gòu)進行檢測。檢測機構(gòu)收到樣本后，對樣本進行核酸提取，核酸提取試劑應(yīng)使用批準(zhǔn)產(chǎn)品說明書中指定的核酸提取試劑盒。zui后是熒光PCR核酸檢測，也就是上機器檢測，將提取物進行熒光PCR擴增反應(yīng)，需要70—80分鐘。